Atelier DATAQUITAINE – Modèles à variables latentes avec application en écologie
L’écologie des communautés s’intéresse aux interactions entretenues par les différentes espèces vivant dans un même écosystème. Ces interactions peuvent être observées directement ou au travers des variations d’abondances des différentes espèces.
Les modèles à variables latentes offrent un cadre confortable pour analyser de telles observations. Ils permettant de modéliser facilement la structure de dépendance entre un grand nombre de variables. Ces modèles posent cependant des problèmes d’inférence statistiques qui peuvent être contournés par des approximations dites variationnelles.
Ces approximations aboutissent à des algorithmes efficaces, mais qui ne sont souvent pas assortis de garanties statistiques.
Programme :
Stéphane Robin a présenté quelques applications de ces modèles à l’écologie des communautés et discuté d’extensions des algorithmes variationnels permettant d’obtenir des mesures d’incertitudes.
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